Außerdem soll ein MOSAIK-räumlicher Atlas von Krebszellen erstellt werden

Owkin, NanoString Technologies und die Krebsforschungseinrichtungen University of Pittsburgh, Gustave Roussy, Universitätsklinikum Lausanne, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg und Charité – Universitätsmedizin Berlin starten MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas In Cancer) im American Jahrestagung der Society of Clinical Oncology.

MOSAIC ist ein 50-Millionen-Dollar-Projekt zur Revolutionierung der Krebsforschung durch den Einsatz räumlicher Omics, einer Reihe von Technologien, die Informationen über die Struktur von Tumoren liefern.

Mit der räumlichen Omics-Methode können Forscher Tumore mit nahezu Einzelzellauflösung untersuchen und gleichzeitig den Ort und die molekulare Aktivität von Tumor- und Immunzellen aufdecken. Es liefert eine detaillierte Karte der molekularen Wechselwirkungen und ermöglicht es Wissenschaftlern, wichtige Beziehungen zwischen einem Tumor und seiner Umgebung zu entschlüsseln.

Durch die Generierung und Analyse räumlicher Omics-Daten in Kombination mit multimodalen Patientendaten und künstlicher Intelligenz möchte MOSAIC die nächste Behandlungswelle für einige der am schwierigsten zu behandelnden Krebsarten eröffnen.

Owkin sagte, MOSAIC sei die erste Initiative dieser Art, die räumliche Omics-Technologie nutzt, und birgt das Potenzial, ein neues Feld in der onkologischen Behandlungsforschung zu eröffnen. Owkin wird 50 Millionen US-Dollar in den Bau von MOSAIC investieren. Es werden 7.000 Tumorproben von Patienten verwendet, was mehr als 100-mal größer ist als alle vorhandenen räumlichen Omics-Datensätze. Owkin und die MOSAIC-Partner werden diese Ressource nach Subtypen immunonkologischer Erkrankungen durchsuchen, um nach Biomarkern und neuartigen Therapien zu suchen.

Thomas Clozel, Mitbegründer und CEO von Owkin, sagte: „Die Konvergenz von räumlichen Omics, multimodalen Patientendaten und KI wird die nächste Revolution in der Onkologieforschung vorantreiben und die nächste Welle bahnbrechender Behandlungen für Patienten ermöglichen. MOSAIC wird uns helfen.“ , und unsere Partner erzielen beispiellose Durchbrüche im Kampf gegen Krebs.“

Brad Gray, Präsident und CEO von NanoString, sagte: „Dieses Projekt hat das Potenzial, unser Verständnis der Krebsbiologie zu verändern und die Entwicklung neuartiger Diagnostika und Therapeutika voranzutreiben. Es handelt sich um eine beispiellose Zusammenarbeit, die die leistungsstarken räumlichen Biologieplattformen von NanoString in höchster Qualität zusammenführt.“ klinisch kommentierte Krebsproben von führenden Krebsforschungszentren und Owkins außergewöhnliche KI-Technologie und -Analyse.“

Robert Ferris, stellvertretender Vizekanzler für Krebsforschung und Hillman-Professor für Onkologie an der University of Pittsburgh School of Medicine und Direktor des UPMC Hillman Cancer Center, sagte: „Die University of Pittsburgh freut sich, Teil des MOSAIC-Konsortiums zu sein, das dies tun wird Nutzen Sie unser räumliches und omisches Fachwissen des UPMC Hillman Cancer Center, um Krebszellen in ihrer Umgebung zu verstehen. Wir freuen uns darauf, mit anderen Universitäten und Industriepartnern zusammenzuarbeiten, um umsetzbare Erkenntnisse zur Erkennung, Behandlung und Vorbeugung von Krebs zu gewinnen.“

Die räumlich aufgelöste molekulare Profilierung (auch bekannt als „Spatial Omics“), die von Nature Methods als Methode des Jahres ausgezeichnet wurde, ist eine fortschrittliche Gruppe von Technologien zur Quantifizierung und Lokalisierung der molekularen Expression, die Wissenschaftlern einen aufschlussreichen Einblick in Tumorstrukturen mit nahezu Einzelzellauflösung ermöglicht Wechselwirkungen zwischen Tumor- und Nicht-Tumorzellen.

Durch die Messung der Expression eines Moleküls und die Zuordnung zu seiner Position in der Tumorprobe können Forscher mithilfe der räumlichen Omics die Heterogenität des Tumors, die Zell-Zell-Kommunikation und die Interaktionen zwischen Tumor und Immunsystem „vergrößern“. Dieser innovative Ansatz wird beispiellose wissenschaftliche Durchbrüche vorantreiben und unser grundlegendes Verständnis von Krankheitsmechanismen verändern.

Nach der Analyse von Patientendaten aus Forschungszentren mithilfe der räumlichen Omics-Technologie von NanoString in Kombination mit RNA-seq, Proteomik, Histologie und anderen medizinischen Daten wird Owkin eine Datenplattform entwickeln und maschinelles Lernen, einschließlich tiefer neuronaler Netze, nutzen, um neuartige Krebsbiologie aufzudecken und mögliche Therapien.

MOSAIC wird sich zunächst auf mehrere Krebsarten mit ungedecktem medizinischem Bedarf konzentrieren, darunter nicht-kleinzelliger Lungenkrebs, dreifach negativer Brustkrebs, diffuses großzelliges B-Zell-Lymphom, Eierstockkrebs, Glioblastom, Mesotheliom und Blasenkrebs. Nach einer ersten Forschungsphase werden MOSAIC und seine standardisierten Methoden zur Datengenerierung und -analyse der globalen biomedizinischen Gemeinschaft zugänglich gemacht und so den Fortschritt in der Onkologieforschung weiter vorantreiben.

Der Umfang von MOSAIC übertrifft bestehende räumliche Omics-Studien deutlich. Bisherige Anstrengungen sind um zwei Größenordnungen zu gering, um Durchbrüche zu erzielen. Derzeit sind die meisten Studien mit diesen Datenmodalitäten durch Stichprobengrößen eingeschränkt, die typischerweise weniger als 50 betragen. Im Gegensatz dazu wird MOSAIC Daten von 7.000 Patienten analysieren und es Wissenschaftlern ermöglichen, an Datenkohorten zu forschen, die 100-mal größer sind als derzeit möglich.