ASCO: KI

Räumliches Omics-Bild aus menschlichem Krebsgewebe

Unter den großen klinischen Studien am ASCO feierte ein neues Forschungsprojekt sein offizielles Debüt mit dem ehrgeizigen Ziel, die Interaktionen von Krebszellen mit ihrer Umgebung in „nahezu Einzelzellauflösung“ abzubilden.

Das Projekt mit dem Namen MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas in Cancer) bringt eine Reihe akademischer Krebsforschungsorganisationen sowie das Unternehmen für künstliche Intelligenz Owkin zusammen, das sich auf Modelle für maschinelles Lernen spezialisiert hat, mit denen neue Biomarker und therapeutische Ziele aus Patientenproben gefunden werden Raumbiologieunternehmen NanoString.

MOSAIC wird mit einer Finanzierung von 50 Millionen US-Dollar von Owkin ins Leben gerufen und wird eine als „Spatial Omics“ bekannte Technik nutzen, die Gensequenzierung mit Bildgebungstechnologien kombiniert, um RNA und Proteine ​​nicht nur auf ihr Vorhandensein oder ihre Menge zu analysieren, sondern auch darauf, wo sie sich physisch befinden befinden sich in Zellen und der Mikroumgebung, in der sie leben.

Nach Angaben des Konsortiums – bestehend aus der University of Pittsburgh, Gustave Roussy, dem Universitätsklinikum Lausanne, dem Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg und der Charité-Universitätsmedizin Berlin – ist das Forschungsprojekt 100-mal größer als alle bestehenden räumlichen Omics Datensatz. Es wird erwartet, dass sich in den kommenden Monaten weitere Organisationen dem Projekt anschließen.

Nach Angaben der Partner werden Daten von rund 7.000 Patienten verschiedener Krebsarten generiert und könnten Forschern helfen, Krebs auf molekularer Ebene besser zu verstehen, verschiedene Krebsarten genauer zu charakterisieren und neue Angriffspunkte zu identifizieren, die schließlich zu neuen, verbesserten Therapien führen könnten . An aktuellen Projekten sind typischerweise weniger als 50 Patienten beteiligt.

„Ich glaube, dass räumliche Omics in Kombination mit KI der Katalysator sind, der die nächste Revolution in der Krebsforschung vorantreibt“, sagte Thomas Clozel, CEO von Owkin, in einem LinkedIn-Beitrag. „Durch die Kombination von Genen mit Geweben und Tumoren mit der Mikroumgebung können Erkenntnisse aus Patientendaten gewonnen werden, die Zelllinienstudien entgehen würden.“

Ein Hauptziel des Konsortiums wird zunächst die Entwicklung von Standards sein, die regeln, wie räumliche Omics-Daten analysiert und verglichen werden sollen, in der Hoffnung, ein gemeinsames Leitfaden für Forschungsgruppen zu erstellen, die in diesem Bereich tätig sind. Die Hoffnung besteht darin, dass mit der Zeit die standardisierten Daten sowie Methoden zur Datengenerierung und -analyse der globalen biomedizinischen Gemeinschaft zugänglich gemacht werden, um die Forschung in diesem Bereich zu beschleunigen.

MOSAIC wird sich zunächst auf Krebsarten mit ungedecktem medizinischem Bedarf konzentrieren, darunter nicht-kleinzelliger Lungenkrebs, dreifach negativer Brustkrebs, diffuses großzelliges B-Zell-Lymphom, Eierstockkrebs, Glioblastom, Mesotheliom und Blasenkrebs, sagten die Partner.